Диссертация
Девятияров Руслан Мансурович
Кандидат наук
Статус диссертации
Кандидат наук
Абрамова Зинаида Ивановна
Доктор наук Профессор
Доктор наук Профессор
Воронежская Елена Евгеньевна
Доктор наук
Мошковский Сергей Александрович
Доктор наук
биологические науки
В данной работе впервые собран транскриптом на уровне отдельных промоторов, активных в эмбриональном развитии домашней курицы (Gallus gallus), как модели развития амниот, включая ранние стадии от 1.5 ч до стадий перед проклевыванием - 20 д. Методом CAGE было аннотировано более 30 тысяч промоторов. Для отдельных этапов развития и типов клеток найдены специфичные промоторы, а также соответствующие им транскрипционные факторы, проведена валидация экспрессии путем гибридизации in situ (PRRX1, VEGFD, LHX9, HOXA11, CRABP1 и HOXD10). Впервые показано, что метод активации генов in vivo с помощью системы CRISPR-on применим для куриного эмбриона, при условии, что известно точное положение точек инициации транскрипции этих генов (Brachyury, SNAI1, CDH1, MMP11 и DENND5B). Впервые в данной работе проведен анализ транскриптома в экспериментах с обратимым охлаждением куриных эмбрионов. Данные CAGE эмбриогенеза были интегрированы на общедоступной интерактивной платформе геномного браузера Zenbu.
| # | Название | Размер |
|---|