Диссертация

Диссертационная работа посвящена исследованию пионерной функции PARP1 в организации хроматина на нуклеосомном уровне. В рамках работы реконструированы in vitro нуклеосомные системы различного состава (включая H2A.Z-содержащие нуклеосомы и хроматосомы с H1.0) и проведён комплексный структурно-функциональный анализ с использованием EMSA, spFRET и вестерн-блота. Показано, что PARP1 реорганизует нуклеосомы по всей длине ДНК, в том числе при варьировании гистонового состава, повышая доступность нуклеосомной ДНК для p53 и dCas9 и тем самым формируя платформу для рекрутирования регуляторных белков. На нуклеосомной системе впервые напрямую сопоставлены механизмы действия клинических ингибиторов PARP1 (олапариба, талазопариба, велипариба), для которых продемонстрирован феномен траппинга, а также показанаспособность природного соединения ресвератрола ингибировать PARP1 через снижение его аффинности к нуклеосомной ДНК. Полученные результаты уточняют молекулярные механизмы пионерной функции PARP1 и открывают возможности для разработки новых биоинженерных подходов к управлению структурой хроматина, оптимизации CRISPR/Cas-технологий и дизайну следующего поколения ингибиторов PARP1.