Диссертация

Пространственная динамика (подвижность) хроматина сопровождает все процессы, протекающие в ядре клетки. Одним из факторов, влияющих на динамику хроматина, может быть когезиновый комплекс (когезин). В данной работе было изучено влияние когезина на пространственную динамику хроматина в норме и при внесении двунитевых разрывов ДНК. Для этого была создана клеточная линия, способная к индуцируемой ауксином деплеции когезина. В полученных клетках с помощью системы CRISPR-Sirius был визуализирован геномный локус в третьем интроне гена TMEM242, находящийся на границе контактного домена. Было показано, что когезин ограничивает локальную пространственную динамику данного локуса как до, так и после его репликации. Также было изучено влияние деплеции когезина на локальную подвижность индуцированных этопозидом фокусов репарации, визуализированных с помощью репортера FusionRed-BP1-2. Было показано, что когезин не влияет на пространственную динамику фокусов репарации ни до, ни после начала репликации ДНК. Стабильность фокусов репарации может иметь функциональное значение, предотвращая ошибочное соединение концов разных разрывов ДНК.