Warning: Undefined property: Dissovet\Models\Dissertation::$performed_in_place2 in /var/www/application/Models/Dissertation.php on line 298
Диссертация

Диссертация

Вакуленко Юлия Александровна

Кандидат наук

Статус диссертации

05.09.2023 
Диплом Кандидат наук
30.08.2023 
Решение о выдаче диплома
30.08.2023 
Положительное заключение АК
27.07.2023 
На рассмотрении в АК
27.04.2023 
Положительная защита
21.03.2023 
Объявление опубликовано
09.02.2023 
Принят к защите
08.02.2023 
Заключение комиссии
23.01.2023 
Документы приняты
ФИО соискателя
Вакуленко Юлия Александровна
Степень на присвоение
Кандидат наук
Приказ о выдаче диплома
№ 1147 от 05.09.2023
Дата и время защиты
27.04.2023 16:00
Место проведения защиты
119234, Москва, Ленинские горы МГУ, д. 1, стр. 12, биологический факультет, ауд. 389
Научный руководитель
Лукашев Александр Николаевич
Член - корреспондент РАН Доктор наук Профессор
Оппоненты
Альховский Сергей Владимирович
Член - корреспондент РАН Доктор наук
Тикунова Нина Викторовна
Доктор наук Доцент
Литов Александр Геннадьевич
Кандидат наук
Место выполнения работы
Московский государственный университет имени М.В.Ломоносова, Биологический факультет, Кафедра вирусологии
Специальность
1.5.10. Вирусология
биологические науки
Диссертационный совет
Телефон совета
+7 495 939-33-60

Объект исследования – нуклеотидные последовательности геномов вирусов, принадлежащих семействам Picornaviridae, Caliciviridae, Astroviridae, Coronaviridae. Цель работы – провести анализ генетического разнообразия, изменчивости и рекомбинации у ряда социально значимых (+)РНК-вирусов млекопитающих, принадлежащих семействам Picornaviridae, Caliciviridae, Astroviridae и Coronaviridae. Проведен систематический анализ рекомбинации в семействах (+)РНК-вирусов Caliciviridae, Astroviridae и Coronaviridae с помощью классических методов детекции рекомбинации, а также методов, разработанных автором диссертации. Показано, что профили рекомбинации внутри участков генома, кодирующих структурные и неструктурные белки, различаются между семействами, но сходны внутри одного семейства РНК-вирусов. Для калицивирусов характерен обмен целыми блоками генов неструктурных и структурных белков и крайне редкая рекомбинация внутри участков, кодирующих структурные и неструктурные белки. Для астровирусов характерен обмен целыми блоками генов неструктурных и структурных белков и умеренная рекомбинация внутри структурных и неструктурных генов. У коронавирусов наиболее часто рекомбинация происходит между геном структурного белка S и другими участками генома. Рекомбинация внутри гена белка S происходит чаще, чем в неструктурной области, причем с большей вероятностью происходит обмен целыми доменами белка S. Гены остальных структурных белков (N, E, M) по профилю естественной рекомбинации соответствуют генам неструктурных белков. Был проведен Байесовский филогенетический анализ фрагментов генома, кодирующих капсидные белки, для 32 типов энтеровирусов. Показано, что глобальная популяция энтеровирусов разных типов регулярно подвергалась «бутылочным горлышкам», что приводило к вымиранию линий. Отдельные типы могут регулярно подвергаться почти полному исчезновению практически в глобальном масштабе даже в течение десятков лет, однако не зафиксировано ни одного примера безвозвратного исчезновения типа энтеровируса. Определены последовательности типирующих фрагментов VP1 коксакивирусов А2, ассоциированных со случаями острого вялого паралича, выделенных в рамках надзора за неполиомиелитными энтеровирусами с 2001 по 2020 год. Опровергнута гипотеза о возникновении варианта коксакивируса А2 с измененными патогенетическими характеристиками.