Диссертация

Сивкина Анастасия Львовна

Кандидат наук

Статус диссертации

03.07.2023 
Диплом Кандидат наук
30.06.2023 
Решение о выдаче диплома
28.06.2023 
Положительное заключение АК
03.03.2023 
На рассмотрении в АК
08.12.2022 
Положительная защита
28.10.2022 
Объявление опубликовано
21.10.2022 
Принят к защите
20.10.2022 
Заключение комиссии
12.10.2022 
Документы приняты
ФИО соискателя
Сивкина Анастасия Львовна
Степень на присвоение
Кандидат наук
Приказ о выдаче диплома
№ 908 от 03.07.2023
Дата защиты
08.12.2022
Место проведения защиты
119234, Москва, Ленинские горы, д.1, стр.12, Биологический факультет, ауд. 389
Научный руководитель
Студитский Василий Михайлович
Доктор наук
Оппоненты
Кульбачинский Андрей Владимирович
Доктор наук
Николаев Лев Григорьевич
Доктор наук
Белоусова Екатерина Анатольевна
Кандидат наук
Место выполнения работы
Московский государственный университет имени М.В.Ломоносова, Биологический факультет, Кафедра биоинженерии
Специальность
1.5.3. Молекулярная биология
биологические науки
Диссертационный совет
Телефон совета
+7 495 939-33-60

Комплекс FACT является АТФ-независимым шапероном гистонов, способным обратимо разворачивать нуклеосомы. Это высококонсервативный комплекс, участвующий в транскрипции, репликации и репарации ДНК. В частности, комплекс FACT необходим для эффективного удаления нуклеосом с промоторных участков генов во время индукции транскрипции, он облегчает преодоление нуклеосомного барьера при элонгации транскрипции и восстановление упаковки хроматина при репрессии транскрипции. На сегодняшний день наиболее исследованы комплексы FACT человека и дрожжей - human FACT (hFACT) и yeast FACT (yFACT), соответственно. FACT взаимодействует со всеми компонентами нуклеосомы, включая нуклеосомную ДНК, тетрамер гистонов Н3/Н4 и димеры гистонов Н2А/Н2В. FACT вызывает реорганизацию нуклеосом, увеличивая доступность нуклеосомной ДНК к различным реагентам и белкам. Ранее было показано, что данный фактор раскручивает нуклеосомную ДНК по механизму «все-или-ничего», обратимо, без гидролиза АТФ, при этом удерживая ДНК и гистоны в одном комплексе. Для разворачивания нуклеосомы необходимо присутствие всех трех субъединиц дрожжевого комплекса yFACT: димера Spt16/Pob3 и белка Nhp6. Человеческий комплекс hFACT состоит из гетеродимера Spt16/SSRP1 и является важной мишенью для противораковых препаратов класса - кураксинов. Субъединицы комплекса FACT (кроме Nhp6) являются мультидоменными белками и содержат функционально значимые, отрицательно заряженные С-концевые участки. Ранее в нашей лаборатории было показано, что hFACT связывается с нуклеосомами и разворачивает их в присутствии кураксинов или белка Nhp6 in vitro. В данной работе механизмы разворачивания нуклеосом комплексом yFACT и hFACT были изучены с использованием ряда различных комплементарных биофизических и биохимических подходов, позволяющих получить информацию о различных аспектах работы этого комплекса. Было продемонстрировано, что комплексы yFACT и hFACT способны разворачивать нуклеосому в линейную структуру. На основании полученных данных предложены модели Nhp6-зависимого и кураксин-зависимого разворачивания нуклеосом белковым комплексом FACT. Белковый комплекс FACT вовлечен в важные биологические процессы в ядре клетки и является важной мишенью для антираковых препаратов. Таким образом, результаты работы могут быть применимы в дальнейших исследованиях структуры и динамики хроматина, а также в медицине.