Диссертация

Видео защиты доступно на сайте Биологического факультета http://www.bio.msu.ru/dissertations/view.php?ID=961 Вирус оспы сливы (Plum pox virus, PPV, род Potyvirus, семейство Potyviridae). Целью работы являлось изучение распространенности и генетического разнообразия PPV в насаждениях косточковых культур в Европейской России и молекулярно-биологическая характеристика выявленных изолятов. Были использованы следующие методы: иммуноферментный анализ, выделение тотальной РНК из растений на колонках и вирусной РНК с помощью иммуносорбции, обратная транскрипция для получения кДНК , ПЦР, ПААГ, вестерн-блоттинг, высокопроизводительное секвенирование геномной РНК вируса. В насаждениях различных косточковых культур в Европейской России обнаружены и охарактеризованы 167 новых изолятов PPV. Секвенированы и депонированы в GenBank 31 полногеномная последовательность российских изолятов PPV и 140 3’-концевых последовательностей различной длины. Открыты два новых штамма вируса – СR (Cherry Russia) и CV (Cherry Volga). Установлено повсеместное распространение считавшихся редкими штаммов W (PPV-W) и С (PPV-C). Показано, что PPV-W является генетически самым изменчивым штаммом вируса. Впервые доказана возможность переноса изолятов этого штамма чертополоховой тлей Brachycaudus cardui и хмелевой тлей Phorodon humuli. Впервые обнаружены внутриштаммовая рекомбинация среди изолятов штаммов W, С и М, а также новые междуштаммовые рекомбинационные события в 5’-концевом участке генома изолятов штаммов C и Rec. Впервые в России и на постсоветском пространстве вообще обнаружены изоляты штамма Rec.