Диссертация

В результате выполненных соискателем исследований изучены функции CRE-кармана РНК-полимеразы – структурного элемента, образованного -субъединицей и контактирующего с нематричной цепью ДНК в транскрипционных комплексах. Показано, что CRE-карман играет важную роль на всех стадиях синтеза РНК; мутации в данном районе влияют на связывание промоторов, элонгацию и терминацию транскрипции. Установлено, что он участвует в узнавании сигналов пауз транскрипции при наличии РНК-шпильки. Впервые открыт и подробно охарактеризован в системах in vitro новый вид транскрипционных пауз, вызванных альтернативной σ38-субъединицей. Теоретическая значимость исследования обоснована, тем, что транскрипционные паузы являются важными участниками регуляции экспрессии генов и, возможно, репарации ДНК. Однако молекулярные механизмы узнавания сигналов пауз во многом остаются неизвестными из-за недостатка структурных данных. Проведенные Петушковым И.В. исследования вносят важный вклад в понимание механизмов узнавания сигналов пауз бактериальной РНК-полимеразой. Практическое значение полученных соискателем результатов заключается в идентификации ранее не известных мутаций в РНК-полимеразе, приводящие к возникновению устойчивости к антибиотику рифампицину, который широко применяется в клинической практике. Также высказано предположение о том, что CRE-регион является хорошей мишенью для создания новых универсальных антибиотиков и ингибиторов транскрипции.