Диссертация

Работа посвящена изучению структуры и функции комплекса интегразы ВИЧ-1 и клеточного белка Ku70. Основная цель работы – установить структурные элементы в составе обоих белков, вовлеченные в образование комплекса между ними, а также установить функциональное значение их взаимодействия. В первой части диссертации показано, что со стороны интегразы ВИЧ-1 во взаимодействии с Ku70 принимают участие аминокислотные остатки с 200 по 220, входящие в состав протяженной α6-спирали. Более того, установлено, что ключевую роль в этом процессе играют аминокислотные остатки интегразы E212 и L213. Со стороны клеточного белка Ku70 во взаимодействии с интегразой принимают участие аминокислотные остатки N-концевого домена с 1 по 250. Также нам удалось показать, что конъюгат эозина с 2’-О-метил олигонуклеотидом 5’-GGUUUUUGUGU-3’, связываясь в районе α6-спирали и С-концевого домена интегразы ВИЧ-1, предотвращает образование комплекса между интегразой и белком Ku70. Во второй части работы изучалась роль взаимодействия между этими белками в жизненном цикле ВИЧ-1. Впервые установлено, что взаимодействие между интегразой ВИЧ-1 и клеточным белком Ku70 критично для успешного завершения репарации повреждений ДНК, возникающих в ходе интеграции ДНК вируса в геном клетки. Это стало возможным благодаря разработке уникального метода оценки эффективности постинтеграционной репарации ДНК, основанного на Alu-специфичном количественном методе ПЦР. Полученные результаты способствуют пониманию механизмов постинтеграционной репарации ДНК, а также могут быть использованы для создания принципиально новых препаратов, подавляющих репликацию ВИЧ-1 на уровне постинтеграционной репарации ДНК и не приводящих к развитию резистентности вируса.