Диссертация

Работа посвящена определению молекулярных механизмов динамических мод, лежащих в основе функционирования хроматина в ядрах клеток. Основные результаты были получены методом моделирования молекулярной динамики с последующим анализом данных в контексте структурных исследований и экспериментов in vitro. Показано спонтанное формирование функционально-важных мод динамики ДНК-гистоновых комплексов: откручивание и скольжение ДНК в нуклеосоме и изменение знака суперспирализации ДНК в тетрасоме. Определена роль пластичности белков-гистонов в этих движениях. Охарактеризован изгиб гистонов как ключевая мода динамики гистонов в составе димеров, взаимодействующих через структурный мотив “рукопожатие”. Продемонстрирована возможность изменения пластичности гистонов при изменении их аминокислотной последовательности. Таким образом, работа раскрывает молекулярно-динамическим механизмы, лежащие в основе связи внутренней динамики гистонов и регуляции функциональных свойств хроматина.