Диссертация

Регуляция сплайсинга у эукариот осуществляется множеством факторов, включающих в себя дальние взаимодействия в структуре РНК. В работе разрабатываются новые вычислительные методы предсказания дальних взаимодействий, а их результаты применяются к изучению влияния структуры РНК на альтернативный сплайсинг и исследованию функциональных последствий этого влияния. Описываются закономерности в расположении РНК-структур по отношению к регуляторным элементам в пре-мРНК, экспериментально показывается их влияние на альтернативный сплайсинг и полиаденилирование, исследуется непродуктивный сплайсинг и его регуляция структурой РНК. В целом диссертация показывает, что дальние взаимодействия в структуре РНК широко распространены в генах эукариот и координируют процессинг РНК во времени и в пространстве на больших расстояниях. Результаты имеют множество биомедицинских приложений, в частности, для терапевтической модуляции сплайсинга антисмысловыми олигонуклеотидами через структуру РНК.