Диссертация

Коваль Владимир Васильевич

Доктор наук

Статус диссертации

27.12.2023 
Снят с рассмотрения и защиты
26.12.2023 
Объявление опубликовано
28.11.2023 
Принят к защите
24.11.2023 
Заключение комиссии
03.11.2023 
Документы приняты
Тема диссертации

Динамическая пластичность ДНК-гликозилаз и эндонуклеаз в комплексах с ДНК: кинетические и структурные особенности

ФИО соискателя
Коваль Владимир Васильевич
Степень на присвоение
Доктор наук
Дата и время защиты
27.02.2024 16:00
Место проведения защиты
Москва, Ленинские горы, д.1 стр.40, ауд. 501
Научный консультант
Пышный Дмитрий Владимирович
Член - корреспондент РАН Доктор наук
Оппоненты
Зверева Мария Эмильевна
Доктор наук
Макаров Александр Александрович
Академик РАН Доктор наук Профессор
Попов Владимир Олегович
Академик РАН Доктор наук Профессор
Место выполнения работы
Институт химической биологии и фундаментальной медицины Сибирского отделения РАН, Объединенный центр геномных, протеомных и метаболомных исследований
Специальность
1.4.9. Биоорганическая химия
1.5.3. Молекулярная биология
химические науки
Диссертационный совет
МГУ.014.2
Телефон совета
+7 495 939-31-53

Фундаментальные знания о белково-нуклеиновом узнавании в надмолекулярных комплексах позволяют выявлять особенности и закономерности таких взаимодействий, создавать новые терапевтические подходы и использовать ферменты как инструменты исследования и коррекции определенных биологических процессов.

Целью настоящей работы являлось установление структурных и динамических механизмов узнавания ДНК-субстратов и реализации каталитической функции ферментами репарации и ферментами геномного редактирования.

В работе применен комплексный методологический подход, включающий изучение кинетических характеристик взаимодействия между ферментом и субстратом, моделирование комплексов по методу молекулярной динамики и использования масс-спектрометрии водородно-дейтериевого обмена для получения динамических структур. Используемый подход позволил достаточно подробно на структурном уровне описать динамическую подвижность изучаемых комплексов.

Результаты, полученные в настоящей работе позволять по-новому оценить природу механизмов взаимодействия белков с нуклеиновыми кислотами и глубже понять фундаментальные основы процессов, обеспечивающих узнавание в белково-нуклеиновых комплексах.