Диссертация

Фундаментальные знания о белково-нуклеиновом узнавании в надмолекулярных комплексах позволяют выявлять особенности и закономерности таких взаимодействий, создавать новые терапевтические подходы и использовать ферменты как инструменты исследования и коррекции определенных биологических процессов.

Целью настоящей работы являлось установление структурных и динамических механизмов узнавания ДНК-субстратов и реализации каталитической функции ферментами репарации и ферментами геномного редактирования.

В работе применен комплексный методологический подход, включающий изучение кинетических характеристик взаимодействия между ферментом и субстратом, моделирование комплексов по методу молекулярной динамики и использования масс-спектрометрии водородно-дейтериевого обмена для получения динамических структур. Используемый подход позволил достаточно подробно на структурном уровне описать динамическую подвижность изучаемых комплексов.

Результаты, полученные в настоящей работе позволять по-новому оценить природу механизмов взаимодействия белков с нуклеиновыми кислотами и глубже понять фундаментальные основы процессов, обеспечивающих узнавание в белково-нуклеиновых комплексах.