Warning: Undefined property: Dissovet\Models\Dissertation::$performed_in_place2 in /var/www/application/Models/Dissertation.php on line 354
Диссертация

Диссертация

Жарикова Анастасия Александровна

Кандидат наук

Статус диссертации

29.12.2022 
Диплом Кандидат наук
21.12.2022 
Решение о выдаче диплома
16.12.2022 
Положительное заключение АК
25.11.2022 
На рассмотрении в АК
29.06.2022 
Положительная защита
23.05.2022 
Объявление опубликовано
20.05.2022 
Принят к защите
19.05.2022 
Заключение комиссии
13.05.2022 
Документы приняты
ФИО соискателя
Жарикова Анастасия Александровна
Степень на присвоение
Кандидат наук
Приказ о выдаче диплома
№ 1582 от 29.12.2022
Дата и время защиты
29.06.2022 15:00
Место проведения защиты
г. Москва, Ленинские горы, д. 1, стр. 73.
Научный руководитель
Миронов Андрей Александрович
Доктор наук Профессор
Оппоненты
Орлов Юрий Львович
Доктор наук
Кулаковский Иван Владимирович
Доктор наук
Медведева Юлия Анатольевна
Кандидат наук
Место выполнения работы
Московский государственный университет имени М.В.Ломоносова, Факультет биоинженерии и биоинформатики, Факультет биоинженерии и биоинформатики
Специальность
03.01.09 Математическая биология, биоинформатика
биологические науки
Диссертационный совет
Телефон совета
+7 495 939-13-57

В работе представлен анализ данных из оригинальной работы по изучению РНК-ДНК интерактома с помощью метода Red-C, опубликованный впервые. Данные подобного типа появились в 2017 году, представлены всего лишь в нескольких публикациях и предоставляют возможность изучать РНК, ассоциированные с хроматином, не имея никаких априорных знаний об этих РНК. Предложенный алгоритм анализа разработан специально для протокола Red-C, однако может быть с легкостью применен и к результатам, полученным с помощью других схожих протоколов. Для аннотации РНК-частей генами была разработана процедура голосования, учитывающая случаи неоднозначной аннотации. На основании дополнительной информации об уровне экспрессии разработана и рассчитана метрика хроматинового потенциала. Предложен подход к изучению характера взаимодействия РНК с хроматином. Несмотря на то, что авторы аналогичных работ отмечали, что наблюдают фрагменты РНК, которые детектированы как контактирующие с ДНК, но не попадали в генную разметку, анализ таких РНК-частей произведен не был. В данной работе таким неаннотированным РНК-частям уделено особое внимание, в результате чего удалось собрать гипотетически новые хроматин-ассоциированные РНК.

# Название Размер