Warning: Undefined property: Dissovet\Models\Dissertation::$performed_in_place2 in /var/www/application/Models/Dissertation.php on line 354
Диссертация

Диссертация

Новичкова Дана Александровна

Кандидат наук

Статус диссертации

09.04.2021 
Диплом Кандидат наук
29.03.2021 
Решение о выдаче диплома
19.03.2021 
Положительное заключение АК
01.12.2020 
На рассмотрении в АК
29.10.2020 
Положительная защита
15.09.2020 
Объявление опубликовано
10.08.2020 
Принят к защите
03.08.2020 
Заключение комиссии
23.07.2020 
Документы приняты
ФИО соискателя
Новичкова Дана Александровна
Степень на присвоение
Кандидат наук
Приказ о выдаче диплома
№ 298 от 09.04.2021
Дата и время защиты
29.10.2020 15:00
Научный руководитель
Лущекина Софья Владимировна
Кандидат наук
Оппоненты
Коваленко Илья Борисович
Доктор наук
Никулин Алексей Донатович
Доктор наук
Мазо Михаил Абрамович
Кандидат наук
Место выполнения работы
Институт биохимической физики им. Н.М. Эмануэля Российской академии наук
Специальность
02.00.15 Кинетика и катализ
физико-математические науки
Диссертационный совет
Телефон совета
+7 495 939-34-35

В данной работе наибольшее внимание уделено моделированию связи структура-динамика-свойства холинэстераз и близких по структуре белков, играющих большую роль в функционировании нервной системы. Цель работы - развитие методики описания структурно-динамических свойств белков методами молекулярного моделирования и применение её к различным системам. В соответствии с поставленной целью решались следующие задачи: 1) выявление закономерностей формирования четвертичной структуры холинэстераз и близких по структуре белков в зависимости от первичной последовательности и динамики мономеров; 2) сравнение структуры и динамики ферментов одного типа различных организмов и их каталитических свойств на примере АХЭ человека и рыбы; 3) исследование влияния точечных мутаций на структурно-динамические свойства и стабильность активного центра фермента на примере БХЭ человека. Для решения поставленных задач были использованы современные методы компьютерной химии: молекулярная динамика с последующим статистическим анализом с применением цепей Маркова; молекулярная динамика с возбуждением свободной энергии; комбинированный метод зонтичной выборки и алгоритма перекрещивающихся распределений для расчёта поверхности свободной энергии; комбинированный метод квантовой механики и молекулярной механики. В результате исследования разработана и применена комбинация методов для качественно и количественного описания структурно-динамических свойств белков. Показаны закономерности стабилизации четвертичной структуры изучаемых белков, Продемонстрировано, что мутант N322E/E325G БХЭ является перспективным для дальнейшего поиска самореактивирующихся мутантов с более высокими скоростями гидролиза ФОС за счёт преобладания формы с активной каталитической триадой при динамических изменениях белка; обнаружено, что различия в кинетике связывания ривастигмина связаны с динамикой белков.

# Название Размер