Диссертация

Диссертационная работа посвящена изучению структурных особенностей потенциал-управляемых калиевых каналов семейства KV1, а также их комплексов с поровыми блокаторами, выделенными из яда скорпионов. В рамках работы были получены структуры комплексов каналов KV1.1, KV1.3 и KV1.6 с пептидными блокаторами семейства α-KTx методом моделирования по гомологии, детально описан интерфейс возникающих между каналами и блокаторами взаимодействий, выделены консервативные и вариабельные контакты. Разработанный алгоритм расчета энергии связывания за счет оценки стабильности образующихся взаимодействий позволил расчетным путем проанализировать различия в связывании пептидных блокаторов с каналами KV1.1, KV1.3 и KV1.6, согласующиеся с экспериментальными данными in vitro. Применение оригинальной методики расчета энергии связывания позволило оценить влияние предложенных мутаций в аминокислотную последовательность аджитоксина 2 на параметры его связывания с каналом KV1.1.